저서 및 역서
장대익(2019), 『사회성이 고민입니다』(휴머니스트)
찰스 다윈 지음/ 장대익 옮김(2019), 『종의 기원(On the Origin of Species)』(사이언스북스)
장대익(2017), 『울트라 소셜』(휴머니스트)
장대익(2017), 『다윈의 정원』(바다출판사) --> 세종도서 선정(2017년)
장대익(2014), 『다윈의 식탁』(바다출판사)[1판, 2008년, 김영사] --> 제27회 한국과학기술도서상 저술상(2009년, 교과부)
장대익(2014), 『다윈의 서재』(바다출판사) --> 아태이론물리센터 올해의 과학책 선정(2014년)
장대익(2014), 『생명은 왜 성을 탄생시켰을까』(와이스쿨)
우희종, 김형숙, 장대익(2014), 『생명』(서울대학교 출판문화원)
장대익(2013), 『인간에 대하여 과학이 말해준 것들』(바다출판사)
홍성욱, 장대익 엮음(2012), 『뇌과학, 경계를 넘다』(바다출판사)
서울대학교 철학사상연구소 엮음(2012), 『마음과 철학:서양편』(서울대학교 출판문화원)
김광웅 엮음(2011), 『융합학문, 어디로 가고 있나?』(서울대학교 출판문화원)
오명석 엮음.장덕진 외 13인(2011), 『서울대 명품강의 2』(글항아리)
김세균 편(2011), 『학문간 경계를 넘어』(서울대학교 출판문화원)
김동광, 김세균, 최재천 엮음(2011), 『사회생물학 대논쟁』(이음)
홍성욱, 장대익 엮음(2010), 『뇌 속의 인간, 인간 속의 뇌』(바다출판사)
신재식, 김윤성, 장대익(2009), 『종교전쟁』(사이언스북스)
장대익(2008), 『다윈의 식탁』(김영사)
장대익(2008), 『과학에는 뭔가 특별한 것이 있다: 쿤&포퍼』(김영사)
장대익(2006), 『다윈&페일리: 진화론도 진화한다』(김영사)
최재천, 장대익 옮김(2005), 『통섭』(사이언스북스)
황상익, 장대익 옮김(2004), 『침팬지 폴리틱스』(바다출판사)
장대익, 정재은 옮김(2003), 『멸종』(문학과지성사)
장대익(2000), 『유전자와 생명의 역사』(몸과마음)
논문
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장대익(2003), 「유전자에 관한 진실을 찾아서: 이기적 유전자 이론에서 발생계 이론까지」, 『ELSI연구』 1권 1호, 61-83.