저서
『메이지유신을 설계한 최후의 사무라이들 : 그들은 왜 칼 대신 책을 들었나』, 21세기북스: 북이십일, 2020.
『메이지유신과 사대부적 정치문화』, 서울대출판문화원, 2019.
『響き合う東アジア史』(共編), 東京大学出版会, 2019.
『메이지 유신은 어떻게 가능했는가』, 민음사, 2014.
『사료로 보는 아시아사』(共著), 위더스북, 2014.
『일본을 말하다』(共著), 경인문화사, 2014.
『일본사의 변혁기를 본다』(共著), 지식산업사, 2011.
『講座 明治維新1: 世界史のなかの明治維新』(共著), 有志舍, 2010.
『의제로 본 한일회담』(共著), 선인, 2010.
『한국의 일본 연구 2002년 - 국내도서관 소장 일본학관련 도서목록Ⅱ』, 서울대학교 국제지역원, 2002.
『작은 정부와 일본 시민사회의 발흥』(共著), 한울아카데미, 2005.
『인물로 본 문화』(共著), 방송통신대학교출판부, 2005.
『근대화와 동서양』(共著), 방송통신대학교출판부, 2006.
『세계의 역사』(共著), 방송통신대학교출판부, 2007.
『세계의 도시와 건축』(共著), 방송통신대학교출판부, 2007.
역서
『일본의 설계자, 시부사와 에이이치 : 망국의 신하에서 일본 경제의 전설이 되기까지』, 21세기북스: 북이십일, 2018.
「한국에서 중국사 연구의 현황」(李成珪 著), 『동양문화연구』, 2001.
「간독자료와 사상사연구의 확대 - 윤만한묘간독의 분석을 중심으로」(李成珪 著), 간독자료연구회, 2002.
「중국의 국제관계에 관한 인식 - 한국인저널리스트 신언준의 시각」, 『周邊から見た20世紀中國―日·韓·台·港·中の對話』, 中國書店, 2002.
『일본이란 무엇인가』, 창작과비평사, 2003.
논문(국문)
「근대일본의 공론정치와 민주주의」, 『동아문화』 57, 2019.
「일본 중국사학자의 중국인식과 ‘공동체론’－혐중(嫌中)의 기원－」, 『동아시아문화연구』 73, 2018.
「'봉건사회'-'군현사회'와 동아시아 '근대'시론」, 『동북아역사논총』 57, 2017.
「'연속하면서 혁신' -幕末정치사와 明治維新을 보는 시각」, 『일본역사연구』 40, 2014.
「19세기 전반 熊本藩에서의 '學的 네트워크'와 '學黨'의 형성」, 『東洋史學硏究』 126, 2014.
「明治維新과 '士大夫的 정치문화’의 도전 : ‘近世’ 동아시아 정치사의 모색」, 『歷史學報』 218, 2013.
「일본근현대사 연구동향」, 『歷史學報』 215, 2012.
「막말기 일본의 대외론」, 김용덕 편, 『일본사의 변혁기를 본다』, 지식산업사, 2011.
「吉田松陰의 대외관-'敵體'와 팽창의 이중구조」, 『東北亞歷史論叢』 30, 2010.
「'名君' 德川齊昭의 對民활동과 그 의의-地方役人접촉과 巡村」, 『日本歷史硏究』 32, 2010.
「18세기후반-막말기 일본인의 '아시아''동양'개념의 형성과 변용」, 『동양정치사상사』 9-2, 2010.
「한일회담 문화재'반환'교섭의 전개과정과 쟁점」, 국민대 일본학연구소 편『외교문서공개와 한일회담의 재조명2: 의제로 본 한일회담』, 선인, 2010.
「근대 초기 동아시아에서 헌정의 수용양태 비교시론」, 『동아시아 근대이행의 세 갈래』(공저), 창작과 비평사, 2009.
「18세기 말~19세기 초 일본에서의 '戰國'적 세계관과 해외팽창론」, 『동양사학연구』 104, 2008.
「류큐처분기 류큐 지배층의 자국인식과 국제관」, 『경계의 섬, 오키나와 - 기억과 정체성』(공저), 논형, 2008.
「19세기 전반 일본의 해방론과 초기 국가주의 형성」, 『일본 우익의 어제와 오늘』(공저), 동북아역사재단, 2008.
「근대초기 한중일에서 헌정의 수용양태 비교시론」, 『일본연구논총』 25, 2007.
「동화론과 오키나와 아이덴티티 오타 쵸후의 동화주의를 중심으로」, 『사회와 역사』 73, 2007.
「『대일본사』 편찬에서 '등전파'의 역할 재고」, 『대구사학』 86, 2007.
「일본사연구의 새로운 동향과 논점」, 『한국의 학술연구 - 역사학』 7, 2006.
「근대일본의 '어린이관'의 형성」, 『동아연구』 49, 2005.
「류구처분기 류구지배층의 자기인식과 국제관」, 『역사학보』 186, 2005.
「덕천시대 막부와 번 재정의 특색」, 『한성사학』 20, 2005.
「근대초기 일본의 공공권 형성과 공론정치」, 『국제지역연구』 12-4, 2003.
「근대일본의 공론형성에 대한 연구동향 - 동경대학 '공론형성연구회'의 경과와 성과」, 『뉴스레터』 17, 2003.
「덕천말기 後期水戶學의 민중관 - 會澤安의 『新論』을 중심으로」, 『역사교육』 85, 2003.
「덕천말기 수호번의 남상운동과 정치공간」, 『역사학보』 173, 2002.
「명치유신을 어떻게 볼 것인가 - 막말유신정치사의 새로운 연구동향」, 『뉴스레터』 14, 2002.
「막말수호번에서 봉서의 정치적 등장과 그 역할」, 『동양사학연구』 77, 2002.
「후기수호학의 정치개혁론에 대한 일고찰」, 『동아시아연구』 1, 2001.
「막말월전번의 막정개혁운동에 대한 일고찰」, 『동아문화』 39, 2001.
「덕천말기 월전번의 거번상락과 송평경영」, 『진단학보』 92, 2001.
「후기수호학의 변통론과 군신관」, 『일본역사연구』 14, 2001.
「막말수호번에서 덕천제소와 등전동호의 관계에 대한 재검토」, 『한성사학』 13, 2001.
「書評: 근세무가사회의 정치구조, 주군오시코메의 구조-근세대명과 가신단(평범사)」, 『동아시아연구』 5, 1999.
논문(외국문)
「武士の政治化と「学党」― 一九世紀前半の日本における「士大夫的政治文化」の台頭」,『公論と交際の東アジア近代』, 東京大学出版会, 2016.
「幕末政治變革と‘儒敎的政治文化’」, 『明治維新史硏究』 8, 2012.
「한일회담 문화재‘반환’교섭의 전개과정과 쟁점」, 『의제로 본 한일회담』, 선인, 2010.의 번역.
「日韓會談における文化財「返還」交涉の展開過程と爭点」, 『歷史としての日韓國交正常化』, 法政大學出版局, 2011.
「十九世紀前半日本における「議論政治」の形成とその意味―東アジア政治史の視点から」, 『講座明治維新』I, 有志舍, 2010.